พฤติกรรมการสืบพันธุ์ของม้าน้ำมีความโดดเด่นตรงที่ตัวผู้มีไข่ ที่ปฏิสนธิ แล้ว หลังจากการเกี้ยวพาราสี อย่างละเอียด ผู้หญิงใช้ anovipositor (ท่อไข่) เพื่อวางไข่ของเธอลงในถุงฟักไข่อยู่ที่โคนหางของตัวผู้ซึ่งไข่จะถูกปฏิสนธิในภายหลัง ไข่ยังคงอยู่ในกระเป๋าระหว่าง 10 วันถึงหกสัปดาห์ ทั้งนี้ขึ้นอยู่กับสายพันธุ์ ในช่วงเวลานี้ ตัวผู้จะเลี้ยงดูลูกที่กำลังพัฒนาโดยควบคุมเคมีของของเหลวภายในกระเป๋า ค่อยๆ เปลี่ยนจากของเหลวภายในร่างกายเป็นน้ำเกลือเมื่อการตั้งครรภ์ดำเนินไป ความรู้ทั่วไปเกี่ยวกับม้าน้ำ  ตัวผู้ยังผลิตสารประกอบ อนินทรีย์ และปล่อยฮอร์โมน เพื่อบำรุงกำลังวัยหนุ่มสาวโปรแลคตินซึ่งช่วยสลายโปรตีนที่ผู้หญิงมอบให้ เมื่อไข่ฟักเป็นตัวตัวผู้จะชักเกร็งและขับลูกออกมาทางช่องเดียวในกระเป๋า เด็กเป็นรุ่นจิ๋วของพ่อแม่ที่ไม่ได้รับการดูแลเพิ่มเติม ตัวผู้สามารถรับไข่ลูกอื่นได้เกือบจะทันทีหลังจากคลอดลูก ในบางสปีชีส์ตัวผู้และตัวเมียจะรักษาพันธะคู่ที่มีคู่สมรสคนเดียวตลอดฤดูผสมพันธุ์และออกลูกจำนวนมาก